اندازه گیری فاصله بین پیکربندی های اتمی

چکیده:

آرایش اتمها در یک ساختاراتمی محدود و یا در یاخته یک ساختار گسترده تعیین کننده ویژگیهای مکانیکی، الکتریکی، مغناطیسی، الکترونی و … آن ساختار است. هر آرایش اتمی، چه به روشهای تجربی مانند پراش اشعه ایکس تعیین شود و چه با روشهای نظری و محاسباتی پیش بینی گردد، آرایه ای از مختصات فضایی اتمها و برداردهای شبکه یاخته فراهم می کند. کمی کردن اختلاف بین پیکربندی ها  که بایستی با مقایسه چنین آرایه هایی انجام شود  پیش بینی ساختارهای چگال و نیز در بیوفیزیک محاسباتی و داروسازی اهمیت اساسی دارد. اما عواملی مانند انتقال یا چرخش صلب یک پیکربندی نسبت به پیکربندی دیگر و یا ترتیب قرار دادن مختصات اتمها در آرایه ها انجام چنین مقایسه ای را بسیارپیچیده می کند. . در این سخنرانی با تعدادی از روشهای تعریف فاصله در فضای پیکربندی ساختارهای اتمی و الگوریتمها و روشهای محاسباتی کارا برای محاسبه آن بررسی شده و کاربرد آنها بر روی نانوساختارهای گوناگونی از مولکولها و مواد گسترده نشان داده می شود.